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La salud pública resalta entre uno de los sectores de mayor relevancia en el municipio.

Hospital Municipal Docente Joaquín Paneca Consuegra.

Yaguajay cuenta con el Hospital Municipal Docente Joaquín Paneca Consuegra, donde se brindan servicios en más de una veintena de especialidades médicas. A ello se unen 4 policlínicos y una red de 61 Consultorios del Médico y la Enfermera de la Familia, que posibilitan la cobertura de salud a toda la población del territorio.

Contamos con:

- 386 Médicos

- Personal de enfermería: 465

- 73 Estomatólogos

- Tecnólogos y otros licenciados: 307

- 26 Psicólogos

Sala de Nefrología, Hospital Municipal Joaquín Paneca.

Además el territorio dispone de otras instituciones de salud como:

- 1 Clínica Estomatológica

- 1 Banco de Sangre

- 32 Farmacias

- 1 Óptica

- 1 Centro de Electromedicina

- Servicios de Rehabilitación en 4 Áreas de Salud

- 2 Hogares de Ancianos

- 1 Casa de Abuelos

- 1 Hogar Materno

- 1 Centro de Salud Mental